本校能源研究中心自89年起，獲得經濟部能源委員會支援，開始進行生質氫能研究計畫，試圖以厭氧醱酵方式，將事業廢棄物轉化為氫氣，主要目的除了開發實用生物厭氧產氫技術，並藉此技術提升產值於生產土壤改良劑協助土壤或底泥污染的復育，充份對於有機廢棄物進行能源與資源化的回收再利用。有效運用大專院校研究人力，進行前瞻性研究，並培育能資源暨生物醱酵科技人才。
　　本研究中心以實際廢棄生質物進行厭氧醱酵產氫程序，依據理論與單純基質的研究成果為基礎，直接應用於事業性的有機廢棄物而發展固體物醱酵產氫技術，從小型試驗的成果，將其應用於中型（100公升）與大型模廠（1000公升）反應槽的量產規模。
　　結合分子生物的技術，對於反應槽內優勢產氫菌的社會結構，提供更新更明確的解析。
　　針對(廢棄）纖維素的水解醣化技術的開發、土壤與底泥生物處理的復育成果相當豐碩。
　　將成果應用於業界的合作發展，加強學界研究成果及產業實廠規模之結合，期可完成整個能源科技發展體系。
　　結合業界推廣土壤改良劑（厭氧醱酵程序副產物）。